CuneiForm - OCR-система с графической оболочкой Yagf.
Редакторы математических формул
OpenOffice Math.
Анализ данных и статистика
R - Среда для статистической обработки данных и работы с графикой на основе языка R.
Математика и символьные вычисления. Алгебра и геометрия
Maxima - свободная система компьютерной алгебры. Имеет широчайший набор средств для проведения аналитических вычислений, численных вычислений и построения графиков. Для работы рекомендуется интерфейс wxMaxima.
wxMaxima - фронтэнд для Maxima на GTK2.
Octave - язык высокого уровня, предназначенный для выполнения математических вычислений. Он представляет собой удобный командный интерфейс для решения линейных и нелинейных математических задач, а также проведения других арифметических экспериментов, используя язык, в большинстве случаев совместимый с Matlab.
QtOctave - графическая оболочка для Octave.
SciLab - OpenSource аналог MathLab. В составе имеется утилита, позволяющая конвертировать документы Matlab.
K3DSurf - Мощная программа визуализации трёхмерных поверхностей.
MathPlot - Система построения 2D-графиков. Идеальна для работы над задачами исследования функций.
SMath Studio Desktop - Бесплатный математический пакет с графическим интерфейсом для вычисления математических выражений и построения двумерных и трёхмерных графиков. Аналог MathCad.
Euclid - ПО для Геометрии сайт проекта - не собран!MiB
Geogebra - ПО для Геометрии
Растровые и векторные редакторы
GIMP - растровый графический редактор, по функциональности не уступает AdobePhotohop.
InkScape - Мощный векторный редактор в формате SVG + uniconvertor для работы с файлами CorelDraw.
Blender - программа 3D-моделирования с продвинутыми возможностями, стоящая в одном ряду с Maya и 3D Studio Max.
TuxPaint - Простой графический редактор для детей и взрослых.
Kolourpaint - Аналог Paint для Windows в KDE'
K3D - Создание анимации.
MyPaint - редактор для планшетов/сенсорных панелей - русский форк
Synfig - свободная анимация
Работа со звуком, музыкой и видео
Audacity - Свободный цифровой редактор звуковых файлов.
LMMS - Свободный аналог FruttyLoops.
Ardour - Правка и сведение аудио.
Kino - Программа для захвата и редактирования DV-видео.
Avidemux - Простой видеоредактор.
Cinelerra Мощный видеоредактор.
VLC - Популярный многофункциональный плейер.
LiVES - видеоредактор
CAD/CAM системы
QCad - 2-мерная САПР с открытым исходным кодом, предназначенная для создания машиностроительных чертержей и архитектурных планов.
Web/Интернет
Mozilla Firefox - Популярный браузер на движке Gecko.
Opera - Популярный браузер со встроенным почтовым клиентом и поддержкой IRC.
Mozilla Thunderbird - Популярный почтовый клиент.
KompoZer - Лёгкий в освоении визуальный редактор (WYSIWYG).
BlueFish - GTK-редактор для веб-дизайнеров и программистов. Поддерживает множество языков программирования и разметки.
MediaWiKi - Движок для построения своей WiKi. собрать метапакет с авторазвертыванием
Qutim - IM-клиент с поддержкой ICQ, Jabber, и других протоколов.
Quanta+ - Web-редактор с WYSIWYG
Программирование
Gambas2 - VISUAL BASIC IDE для создания программ на основе Qt, GTK, OpenGL, SDL а также CGI WEB.
FreeBASIC - Реализация BASIC для обучению программированию, совместимая с MS QBasic. ([1])
FreePascal - Компилятор Pascal и Object Pascal - в качестве IDE рекомендуется Lazarus или Geany.
Lazarus - GTK2 и Qt4 IDE для FreePascal.
Mono - Реализация языка C#/VB и платформы .NET на Linux.
MonoDevelop - GTK2 IDE для MONO. Аналог Visual Studio.
Geany - Простая IDE для FreePascal, С, С++ и т.п. + плагины.
SwiProlog - Интерпретатор языка SWI-Prolog.
GProlog - Интерпретатор языка gprolog.
Scratch - Программирование для детей на основе Logo.
Gnome-DB- Среда для работы с БД, нетребовательная к ресурсам.
Mergeant — Программа для непосредственной работы с БД в графическом режиме мастеров.
PostgreSQL - Профессиональная СУБД.
FireBird - Профессиональная СУБД.
Flamerobin - Графический клиент для FireBird.
Рисование схем и диаграмм
DIA - Свободный редактор диаграмм. Может быть использован для рисования различных видов диаграмм: статических структур UML, баз данных, диаграмм сущность-связь, радиоэлектронных элементов, потоковых диаграмм, сетевых диаграмм и других.
Freemind - Построение "карт памяти".
Моделирование
Qucs - Система построения и моделирования электронных схем.
Phun - Симулятор физики.
KTechLab - Система построения и моделирования электронных и электрических схем.
Экономика и менеджмент
OpenProj - Свободный аналог MS Project.
Администрирование
Squid иDansGuardian - Прокси-сервер. Устанавливается в ручном режиме.
DrakWizard - "Мастера" развёртывания серверов.
Обучение
GCompris - Среда обучения для детей 3-10 лет.
KDEEDU — Набор учебных программ KDE4.
Дополнительное ПО
WINE — Набор API для эмулирования среды Microsoft Windows.
VirtualBox - Система виртуализации, позволяющая запускать различные операционные системы.
DosEmu - Эмулятор MS-DOS + образ FreeDOS для него.
ClamAV - Свободный антивирус.
Clamtk - Лёгкая графическая оболочка для ClamAV.
FBReader — Программа для чтения электронных книг в различных форматах.
xneur — Переключалка раскладки.
qmmp - Аналог WinAMP на Qt.
Кодеки и шрифты
MaxLab - Виртуальные тренажёры от НИИ ЭОР.
Mando - интерфейс, превращающий белую доску (whiteboard), проектор и лазерную (светодиод) указку в интерактивную доску
iTalc - система дистанционной работы ученика и преподавателя